Suscrito por los Gobiernos de Estados Unidos y Colombia, y por las Organizaciones The Nature Conservancy (TNC), Conservation International (CI) y el World Wildlife Fund (WWF) en 2004, el Acuerdo tiene como objetivo promover acciones de conservación en las áreas seleccionadas en los Andes, El Caribe y los Llanos.
Los recursos para la implementación de dichas acciones, provienen de una operación de Canje de Deuda. Esta es una opción de inversión de deuda bajo la Ley de Conservación de Bosque Tropical (TFCA, por su sigla en inglés), la cual fue creada en 1998 para ayudar a países con importantes extensiones de bosque tropical a reducir su deuda con el gobierno de Estados Unidos, al tiempo que protege sus bosques.
Las actividades de conservación contempladas para este propósito, van desde el establecimiento de nuevas áreas y reservas protegidas (públicas y privadas); la restauración y mantenimiento de áreas protegidas existentes, el desarrollo e implementación de un sistema de manejo de recursos naturales, aplicando prácticas de manejo a nivel de ecosistema; hasta el diseño e implementación de programas de formación para mejorar las capacidades y habilidades científicas, técnicas y de manejo de los individuos y organizaciones involucrados en las iniciativas de conservación. Cabe anotar que estos programas se concentran en el fortalecimiento de las capacidades directamente relacionadas con la política de participación social de áreas protegidas, la planeación y el manejo efectivo de las mismas, y la promoción de procesos locales de conservación.